解析蛋白质的结构和功能是理解生命奥秘的必经之路，是本实验室的重点研究目标。为此，本实验室的主要研究工作包括：1）高精度的蛋白质结构和功能预测方法；2）基于冷冻电镜数据的蛋白质结构建模方法；3）蛋白质与配体相互作用位点及其空间姿态预测方法。近来，实验室还对蛋白质设计进行了深入研究。实验室的研究成果将致力于人类对生命运作规律的认知，加快靶标发现和药物设计的进程。

研究方向
  • 蛋白质结构预测
  • 蛋白质模型质量评估
  • 蛋白质功能位点预测
  • 冷冻电镜辅助的蛋白质结构建模
  • 蛋白质大分子结构组装
  • 基于机器学习的蛋白质结构精修和设计
  • 蛋白质折叠路径预测
    • 课题组动态
    • 2025年9月30日，博士侯铭桦、夏瑜豪投稿论文《High-accuracy protein complex structure modeling based on sequence-derived structure complementarity》录用于《Nature Communications》期刊。
    • 2025年9月24日，周晓根教授应邀在2025亚洲药物设计大会做特邀报告：An automated protocol for multi-domain protein structure and function prediction，博士生刘栋、崔新月、吕泽鑫、张子莹及硕士生葛灵宇参与大会墙报征集并获得优胜奖。
    • 2025年8月28日，张贵军教授主持的《蛋白质复合物结构模型质量评估方法研究》课题，获得国家自然科学基金面上项目资助。
    • 2025年8月20日，硕士生吕泽鑫投稿论文《MultiSAAI: Sequence-informed antibody-antigen interactions prediction using multi-scale deep learning》录用于《Journal of Chemical Information and Modeling》期刊。
    • 2025年6月24日，博士生梁方被评为“浙江工业大学优秀共产党员”，硕士生叶恩嘉被评为“信息工程学院优秀共产党员”。